Afgelopen week is een nieuw apparaat in gebruik genomen op het laboratorium experimentele neurologie van het UMC Utrecht. Dankzij Stichting ALS Nederland kon het apparaat worden aangeschaft. Het werken met DNA monsters is met dit apparaat sneller en meer secuur dan ooit.

Dit apparaat, de Fluid X tube picker, is een robot die de juiste buisjes met DNA-samples selecteert voor elke analyse.

Neuroloog en hoogleraar Jan Veldink: “De FluidX tube picker maakt het mogelijk om zonder (menselijke) fouten een veelheid aan “labbuizen” te sorteren en selecteren. Dit helpt bijvoorbeeld bij het voorbereiden van veel platen met DNA-samples voor Project MinE.”

DNA-monsters van samenwerkende ALS centra van andere deelnemende landen sturen samples op naar het UMC Utrecht. Hier worden deze DNA-monsters voorbereid voor de whole genome sequencing (WGS). De samples worden op de juiste concentratie gebracht en in platen gezet. Met de tube picker worden hiervoor de buisjes met de juiste DNA-monsters geselecteerd.

 

Senior laborant Peter Sodaar licht toe: “Het rek met DNA-samples zetten we in het apparaat. In elk rek zitten 96 buisjes met elk een DNA-sample van één patiënt of controlepersoon. Onderaan het buisje zit een QR-code. Het apparaat scant deze code en weet dan precies om welk DNA-sample het gaat. Hiermee selecteer je een groep patiënten met een specifiek ziektebeloop voor nader onderzoek. Het apparaat kan bijvoorbeeld alle samples bij elkaar zetten van patiënten met een afwijking in het C9orf72-gen. Hierdoor is het proces heel veilig en komen verwisselingen niet voor.”