I dati di oltre 2.500 profili del DNA sono stati spediti tramite connessione dati diretta dal nostro sequenziatore Illumina negli USA al supercomputer nei Paesi Bassi. Complessivamente, il Progetto MinE ha i dati di oltre 4.500 profili del DNA pronti da analizzare.
Dopo il sequenziamento del genoma intero, Illumina da San Diego, USA, invia i dati al supercomputer SURFsara nei Paesi Bassi, dove i dati vengono salvati e archiviati al sicuro. L’organizzazione non-profit SURFsara garantisce un’archiviazione rapida e sicura di tutti i petabyte dei dati per il Progetto MinE. Si tratta di una parte cruciale del Progetto MinE, poiché necessita di una maggior capacità di archiviazione e analisi di quanta ce ne sia mai stata per progetti precedenti.
Tutti i ricercatori che collaborano al Progetto MinE possono analizzare i loro dati sulla rete SURFsara. Ciò consente di effettuare analisi in modo rapido ed efficiente. Questa infrastruttura ICT accessibile a livello internazionale consente l’analisi combinata di migliaia di file del genoma intero non ancora elaborati. Una prestazione unica. Con una normale rete di computer ci vorrebbero circa 600 anni per fare analisi con queste grandi quantità di dati di sequenziamento.
Il nostro obiettivo è di trovare le variazioni genetiche che causano la SLA.
I ricercatori del Progetto MinE stanno avviando le analisi con dati i di sequenziamento del genoma intero di 4.500 profili del DNA. I nostri ricercatori stanno lavorando per confrontare i dati dei profili del DNA intero dei pazienti affetti da SLA con quelli dei profili del DNA dei soggetti sani (soggetti di controllo). Con queste analisi mirano a trovare variazioni genetiche correlate alla SLA.
Project MinE. Make it yours!